Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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COL4A6Q14031 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
COL4A6Q14031 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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COL4A6Q14031 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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