RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RRN3P1-201ENST00000514813 ABCC9O60706 1549 aa13.13□□□□□ -0.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.25□□□□□ -0.45
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RRN3P1-201ENST00000514813 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.03□□□□□ -0.48
RRN3P1-201ENST00000514813 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC24A1O60721 1099 aa11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1-201ENST00000514813 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.85□□□□□ -0.51
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RRN3P1-201ENST00000514813 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.55□□□□□ -0.56
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RRN3P1-201ENST00000514813 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.41□□□□□ -0.58
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RRN3P1-201ENST00000514813 ERCC6Q03468 1493 aa11.38□□□□□ -0.59
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RRN3P1-201ENST00000514813 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.14□□□□□ -0.63
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RRN3P1-201ENST00000514813 HMGXB3Q12766 1538 aa11.1□□□□□ -0.63
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RRN3P1-201ENST00000514813 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB22O15209 634 aa10.91□□□□□ -0.66
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RRN3P1-201ENST00000514813 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
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RRN3P1-201ENST00000514813 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1-201ENST00000514813 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1-201ENST00000514813 KIF27Q86VH2 1401 aa10.6□□□□□ -0.71
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RRN3P1-201ENST00000514813 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
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RRN3P1-201ENST00000514813 SYNJ1O43426 1573 aa10.57□□□□□ -0.72
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