Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SYCP3-201ENST00000266743 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 GCG-201ENST00000375497 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SNX18P8-201ENST00000455120 874 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RPL19P13-201ENST00000483119 583 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC002428.1-201ENST00000523722 771 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 TBX5-AS1-203ENST00000531202 822 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AP002991.1-201ENST00000539305 574 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC024270.1-201ENST00000559181 404 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 GS1-279B7.1-201ENST00000562817 399 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC018554.2-201ENST00000563482 261 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC100843.3-201ENST00000591796 259 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC245041.1-201ENST00000619523 826 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 IKZF3-214ENST00000467757 1362 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC097717.1-227ENST00000594069 1322 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 TRAV17-201ENST00000390445 484 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 VN1R13P-201ENST00000406212 885 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC092098.1-201ENST00000429245 874 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RN7SL192P-201ENST00000584303 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC114810.1-201ENST00000607415 473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.7 ms