Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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