RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578701.5

AQP4-AS1-202, AQP4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AQP4-AS1, Length 2,177 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4-AS1-202ENST00000578701 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 MSH5O43196 834 aa18.92■□□□□ 0.62
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 RNF39Q9H2S5 420 aa16.02■□□□□ 0.15
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 KCNA4P22459 653 aa14.83□□□□□ -0.04
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 CAPN15O75808 1086 aa14.7□□□□□ -0.06
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 ABCC9O60706 1549 aa13.05□□□□□ -0.32
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.99□□□□□ -0.33
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.91□□□□□ -0.34
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.76□□□□□ -0.37
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AQP4-AS1-202ENST00000578701 CLCN6P51797 869 aa12.71□□□□□ -0.37
AQP4-AS1-202ENST00000578701 CHADLQ6NUI6 762 aa12.69□□□□□ -0.38
AQP4-AS1-202ENST00000578701 SCRIBQ14160 1630 aa12.69□□□□□ -0.38
AQP4-AS1-202ENST00000578701 PLSCR2Q9NRY7 297 aa12.67□□□□□ -0.38
AQP4-AS1-202ENST00000578701 PRR29P0C7W0 189 aa12.65□□□□□ -0.38
AQP4-AS1-202ENST00000578701 POTEIP0CG38 1075 aa12.64□□□□□ -0.39
AQP4-AS1-202ENST00000578701 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
AQP4-AS1-202ENST00000578701 CD44P16070 742 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
AQP4-AS1-202ENST00000578701 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
AQP4-AS1-202ENST00000578701 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.52□□□□□ -0.41
AQP4-AS1-202ENST00000578701 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.51□□□□□ -0.41
AQP4-AS1-202ENST00000578701 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
AQP4-AS1-202ENST00000578701 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
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