RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
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CTXN3-201ENST00000379445 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
CTXN3-201ENST00000379445 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.49■□□□□ 0.39
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CTXN3-201ENST00000379445 ADRA2BP18089 450 aa15.44■□□□□ 0.06
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CTXN3-201ENST00000379445 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTXN3-201ENST00000379445 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.31□□□□□ -0.12
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CTXN3-201ENST00000379445 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.13□□□□□ -0.15
CTXN3-201ENST00000379445 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.12□□□□□ -0.15
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CTXN3-201ENST00000379445 SMARCA4P51532 1647 aa13.62□□□□□ -0.23
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CTXN3-201ENST00000379445 SMARCA2P51531 1590 aa13.59□□□□□ -0.23
CTXN3-201ENST00000379445 HMGXB3Q12766 1538 aa13.59□□□□□ -0.23
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CTXN3-201ENST00000379445 CUX2O14529 1486 aa13.48□□□□□ -0.25
CTXN3-201ENST00000379445 ERCC6Q03468 1493 aa13.48□□□□□ -0.25
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CTXN3-201ENST00000379445 NESP48681 1621 aa13.44□□□□□ -0.26
CTXN3-201ENST00000379445 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.41□□□□□ -0.26
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CTXN3-201ENST00000379445 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.35□□□□□ -0.27
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CTXN3-201ENST00000379445 RNF39Q9H2S5 420 aa13.3□□□□□ -0.28
CTXN3-201ENST00000379445 WIZO95785 1651 aa13.28□□□□□ -0.28
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CTXN3-201ENST00000379445 POTEHQ6S545 545 aa13.24□□□□□ -0.29
CTXN3-201ENST00000379445 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.23□□□□□ -0.29
CTXN3-201ENST00000379445 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CTXN3-201ENST00000379445 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.17□□□□□ -0.3
CTXN3-201ENST00000379445 WDR62O43379 1518 aa13.15□□□□□ -0.3
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CTXN3-201ENST00000379445 SLC24A1O60721 1099 aa13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-201ENST00000379445 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-201ENST00000379445 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-201ENST00000379445 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-201ENST00000379445 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-201ENST00000379445 KCNA4P22459 653 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-201ENST00000379445 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.99□□□□□ -0.33
CTXN3-201ENST00000379445 PRDM2Q13029 1718 aa12.92□□□□□ -0.34
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CTXN3-201ENST00000379445 ABCC8Q09428 1581 aa12.82□□□□□ -0.36
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CTXN3-201ENST00000379445 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.82□□□□□ -0.36
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM41Q8WV44 630 aa12.8□□□□□ -0.36
CTXN3-201ENST00000379445 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
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CTXN3-201ENST00000379445 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.68□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 CUX1P39880 1505 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 SOGA1O94964 1423 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 ARHGEF11O15085 1522 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-201ENST00000379445 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
CTXN3-201ENST00000379445 WDR97A6NE52 1622 aa12.62□□□□□ -0.39
CTXN3-201ENST00000379445 CHD1O14646 1710 aa12.61□□□□□ -0.39
CTXN3-201ENST00000379445 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.59□□□□□ -0.39
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