Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVW-1Q9UQF0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms