Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF24Q9UPV7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF24Q9UPV7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms