Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms