Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF639Q9UID6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms