Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms