Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms