Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP2Q9NS61 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms