Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB18Q9NP72 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms