Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP3Q9H6T3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms