Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF541Q9H0D2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF541Q9H0D2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms