Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms