Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG101Q9BSB4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms