Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms