Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms