Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS2Q96PQ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms