Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms