Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ARAP1Q96P48 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARAP1Q96P48 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms