Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms