Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms