Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms