Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTERF3Q96E29 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms