Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC102AQ96A19 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms