Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SMARCC1Q92922 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCC1Q92922 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms