Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRUQ92729 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms