Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
TOPBP1Q92547 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms