Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms