Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms