Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL34Q8N239 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL34Q8N239 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms