Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC2Q8N158 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC2Q8N158 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms