Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP1Q7RTM1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms