Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC141Q6ZP82 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms