Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNE3Q6ZMZ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE3Q6ZMZ3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms