Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms