Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms