Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC137Q6PK04 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms