Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIRMAQ69YN4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIRMAQ69YN4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms