Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms