Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVEP1Q4LDE5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms