Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX4Q33E94 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX4Q33E94 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms