Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX7Q2KHR2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms