Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ZNF239Q16600 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ZNF239Q16600 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF239Q16600 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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