Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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