Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SSX1Q16384 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SSX1Q16384 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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