Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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